После событий первой части мутанты все еще не могут найти общий язык с обычным обществом: большинство людей их боятся, не доверяют и считают угрозой для своей безопасности. Их и без того непростое положение становится еще более отчаянным, когда на команду профессора Ксавьера совершается мощная атака неизвестного противника, обладающего экстраординарными способностями.
