После триумфа над Ханом и создания экспериментальной планеты Генезис капитан «Энтерпрайза» Джеймс Т. Керк не может радоваться победе: он потерял одного из самых близких друзей, Спока, который пожертвовал собой, чтобы спасти корабль, а его второй лучший друг, доктор Мак-Кой, начинает сходить с ума от нахлынувших в его сознание чужих воспоминаний вулканца.
